Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou3f1P21952 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms