Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P18529 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18529 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P18529 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18529 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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P18529 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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P18529 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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P18529 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18529 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P18529 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18529 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18529 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18529 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18529 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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