Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18524 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18524 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18524 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18524 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18524 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18524 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18524 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18524 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18524 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms