Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms