Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf271P15620 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Znf271P15620 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf271P15620 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms