Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms