Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms