Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc9P09633 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms