Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrygdP04342 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms