Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms