Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Notch2O35516 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms