Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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H2-Q1O19441 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Q1O19441 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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H2-Q1O19441 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Q1O19441 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Q1O19441 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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H2-Q1O19441 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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H2-Q1O19441 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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H2-Q1O19441 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms