Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28051J3QMA2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28051J3QMA2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms