Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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