Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm21818J3KMS6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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