Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms