Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r67G5E8C1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r67G5E8C1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms