Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms