Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17093F6XGJ4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms