Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp988F6VKC7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp988F6VKC7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp988F6VKC7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp988F6VKC7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp988F6VKC7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms