Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms