Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms