Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4E9QAP7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms