Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc7bE9Q9Y3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc7bE9Q9Y3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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