Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sfta2E9PXB6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfta2E9PXB6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms