Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms