Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh8D3Z6W3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms