Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms