Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn24D3YXJ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn24D3YXJ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms