Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms