Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JrklB2RRL2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms