Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BC035947B2RQY6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC035947B2RQY6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BC035947B2RQY6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BC035947B2RQY6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC035947B2RQY6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC035947B2RQY6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC035947B2RQY6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms