Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms