Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms