Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71e1A1L3C1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam71e1A1L3C1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam71e1A1L3C1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam71e1A1L3C1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam71e1A1L3C1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms