Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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