Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gria4Q9Z2W8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria4Q9Z2W8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria4Q9Z2W8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria4Q9Z2W8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gria4Q9Z2W8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms