Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt16Q9Z2K1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt16Q9Z2K1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt16Q9Z2K1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt16Q9Z2K1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt16Q9Z2K1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt16Q9Z2K1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt16Q9Z2K1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt16Q9Z2K1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms