Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2F6

Bcl3, B-cell lymphoma 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl3Q9Z2F6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bcl3Q9Z2F6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bcl3Q9Z2F6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bcl3Q9Z2F6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Bcl3Q9Z2F6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bcl3Q9Z2F6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bcl3Q9Z2F6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms