Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd2Q9Z2E1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd2Q9Z2E1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd2Q9Z2E1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd2Q9Z2E1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms