Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdpk1Q9Z2A0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdpk1Q9Z2A0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdpk1Q9Z2A0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdpk1Q9Z2A0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms