Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xpr1Q9Z0U0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xpr1Q9Z0U0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xpr1Q9Z0U0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xpr1Q9Z0U0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms