Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pacsin2Q9WVE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin2Q9WVE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin2Q9WVE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pacsin2Q9WVE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pacsin2Q9WVE8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacsin2Q9WVE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacsin2Q9WVE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacsin2Q9WVE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacsin2Q9WVE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacsin2Q9WVE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin2Q9WVE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacsin2Q9WVE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacsin2Q9WVE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pacsin2Q9WVE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms