Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn5Q9WVD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn5Q9WVD4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn5Q9WVD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn5Q9WVD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn5Q9WVD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clcn5Q9WVD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms