Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Slit3Q9WVB4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slit3Q9WVB4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Slit3Q9WVB4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Slit3Q9WVB4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Slit3Q9WVB4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Slit3Q9WVB4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Slit3Q9WVB4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slit3Q9WVB4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slit3Q9WVB4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Slit3Q9WVB4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slit3Q9WVB4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit3Q9WVB4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Slit3Q9WVB4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Slit3Q9WVB4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Slit3Q9WVB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Slit3Q9WVB4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Slit3Q9WVB4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Slit3Q9WVB4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms