Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx1Q9WV80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx1Q9WV80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx1Q9WV80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx1Q9WV80 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx1Q9WV80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx1Q9WV80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms