Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6cQ9WTM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6cQ9WTM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema6cQ9WTM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6cQ9WTM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6cQ9WTM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6cQ9WTM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6cQ9WTM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms