Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sae1Q9R1T2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sae1Q9R1T2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sae1Q9R1T2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sae1Q9R1T2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sae1Q9R1T2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sae1Q9R1T2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms