Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trex2Q9R1A9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trex2Q9R1A9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trex2Q9R1A9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trex2Q9R1A9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms