Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plod1Q9R0E2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod1Q9R0E2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod1Q9R0E2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plod1Q9R0E2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plod1Q9R0E2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plod1Q9R0E2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms